Il sistema di qualità secondo il quale Aquilab eroga servizi di campionamento e rilevamento, prove di laboratorio in materia di emissioni in atmosfera, analisi acque, rifiuti, igiene nei luoghi di vita e di lavoro e medicina del lavoro e Sorveglianza Sanitaria è riconosciuto dalle seguenti certificazioni: 

UNI EN ISO 9001:2008                   

UNI EN ISO 14001:2004                  

Aquilab è qualificato inoltre a svolgere attività analitiche relativamente alle due metodiche in microscopia ottica in contrasto di fase: MOCF MASSA; MOCF aerodispersi ed FTIR – Progetto amianto Ministero della Salute CCM (Centro Controllo Malattie) ISPESL.